甜瓜蔗糖转化酶基因的密码子偏好性分析

来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zhangyanfangzhang

【摘要】

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以甜瓜蔗糖转化酶基因序列为材料，研究甜瓜蔗糖转化酶基因密码子偏好性，为改良甜瓜风味与品质提供理论依据。运用在线分析软件CodonW对甜瓜蔗糖转化酶的编码序列（Codingsequence

【作者】

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赵莉李思怡张立虎李冠

【机构】

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新疆大学生命科学与技术学院

【出处】

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生物信息学

【发表日期】

：

2016年2期

【关键词】

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甜瓜蔗糖转化酶密码子偏好性 Cucumis melo L. Invertase Codon usage

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以甜瓜蔗糖转化酶基因序列为材料，研究甜瓜蔗糖转化酶基因密码子偏好性，为改良甜瓜风味与品质提供理论依据。运用在线分析软件CodonW对甜瓜蔗糖转化酶的编码序列（Codingsequence，CDS）进行密码子分析，利用Mobyle在线工具分析同义密码子相对使用度（RSCU）、有效密码子数（ENC）、Gc及GC1s、GC2s、GC3s含量。甜瓜蔗糖转化酶基因偏好于以A或T结尾的密码子。密码子ATT、GTT和AGA的RSCU值都大于1，属于共同偏好使用的密码子，而密码子GCG、CGG的RSCU值小于1，属于使用

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