农作物钾离子通道基因的生物信息学分析

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以AtAKT1所编码的氨基酸序列为检索序列,通过对GenBank NR数据库以及EMBL、DDBJ、PDB数据库进行检索,发现水稻、小麦、大麦、玉米、烟草等作物中具有cds全长的34个疑似K+通道基因。其中:水稻7个,玉米6个,烟草4个,马铃薯、胡萝卜、大麦各3个,葡萄、番茄各2个,蚕豆、小麦、油菜、甜瓜等各1个;有25个基因经过功能验证确定为K+通道基因。利用比较基因组学,将剩余的9个基因确定为K+通道基因。对34个K+基因进化关系的分析表明,与AtAKT1的同源性较高的K+通道基因为马铃薯的SKT1(
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