毛果杨HMA基因家族的生物信息学分析

来源 :植物生理学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gongwj123
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
重金属转运ATP酶(heavy metal transporting ATPase,HMA)是一种通过水解ATP跨膜运送重金属阳离子的转运蛋白,属于P-ATPase家族中一个亚类。不同HMA蛋白对重金属离子的转运具有选择性,在植物修复重金属污染土壤方面起着重要作用。依据毛果杨全基因组测序的结果,以及HMA基因蛋白的序列和功能特征,从毛果杨基因组中鉴定了13个HMA基因家族成员,分属于Zn亚类(Zn2+/Co2+/Cd2+/Pb2+P1B-ATPase)和Cu亚类(Cu+/Ag+P1B-ATPase)两个亚家族,主要分布于1、3号染色体上。生物信息学分析表明,毛果杨HMA基因的氨基酸序列一致性介于21.3%~89.3%,且具有保守的基序CPC、HP、DKTGT、TGEx、GDG、PxD和CxxC等。蛋白理化特征分析显示,多数毛果杨HMA蛋白稍偏酸性,结构稳定性较好,蛋白脂溶指数高,稍具疏水性。密码子偏好性分析显示,毛果杨HMA蛋白14个氨基酸中存在16个高频密码子,另有1个终止密码子为高频密码子,显示出毛果杨的种属特征。研究结果展示了毛果杨HMA基因家族的基本信息和特点,为深入研究毛果杨HMA基因的功能搭建了基础平台。
其他文献
<正> 第一次世界大战打响一年半之后,德国、奥地利保加利亚等同盟国军队已压倒了巴尔干战线上的塞尔维亚军队,同时也把东线的沙俄军队打得晕头转向。于是,德国把近五十万军队
高速公路是经济发展的必然产物,它不仅是交通运输现代化发展的标志,也是一个国家发展工业化和城市化的标志。但是因为其建设、养护、维修等成本的资金需求巨大,以及世界各国家经
<正>只要本身有"实力",就会有忠实的"粉丝"。在德国,看中医是一种贵族享受,个人支付的费用是看西医的10倍以上。德国的社保制度非常健全,一般来说,看病一次诊金10欧元,还可以
期刊
按一定的升温制度将酚醛树脂初始样进行最高温度为200℃的固化处理,随后将样品分别在450、550、650、750℃进行裂解色谱、质谱解析。结果表明,裂解过程中,酚醛树脂结构中活性
对耐热弹性合金材料的抗松弛性能、弹性模量、弹簧扭矩进行了重点分析和研究。研究了合金在不同热处理工艺下对松弛率力学性能的影响,以及弹簧扭矩随扭转角度的变化情况。结
生物体内碳酸钙的矿化过程受有机基质的调控。本文综述了基质蛋白和各类模型基质调控下碳酸钙矿化的研究进展。有机基质提供碳酸钙成核和生长的模板,调控碳酸钙晶体的结晶学
目前,国内各城市的排水系统和河道排涝系统分属于不同的管理机构,遵循不同的标准规范。该文研究了城镇排水标准和排涝标准在设计暴雨选样方法、设计流量方法、设计暴雨历时、
公务员退出机制的建立是公务员运行机制中必不可少的重要环节,关系到国家公务员队伍素质的提升,行政机关的效率提高,政府形象的树立。但是在公务员制度的改革中,公务员退出机制与
环糊精是系列环状低聚糖,具有独特的疏水空腔结构,可以包合一些臭气分子.文中介绍了环糊精的除臭机理及其处理技术,并就环糊精在纺织品除臭整理中的应用作了详细的叙述.
利用压水试验资料分析了主厂房区岩体在水平方向和垂直方向的渗透性。在水平方向,主厂房区岩体的渗透性以微透水-弱透水为主,部分甚至不透水,个别岩体中等透水,厂房位于比周