【摘 要】
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目的分析肺动脉高压(PAH)肺组织来源的表达谱基因芯片数据,研究差异表达基因。方法检索基因表达谱汇编数据库中GSE15197数据。用非监督性聚类、监督性分类、主成分分析的方法
【机 构】
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首都医科大学附属北京朝阳医院检验科,北京市呼吸和肺循环疾病重点实验室
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目的分析肺动脉高压(PAH)肺组织来源的表达谱基因芯片数据,研究差异表达基因。方法检索基因表达谱汇编数据库中GSE15197数据。用非监督性聚类、监督性分类、主成分分析的方法得到可以将PAH肺组织样本与正常对照区分开的显著差异的特征基因。用基因功能注释分析和蛋白间关联分析方法描述PAH特征基因的功能及涉及的相关信号通路。结果与正常对照相比,PAH肺组织表达显著差异特征基因有167个,功能上主要涉及蛋白的乙酰化、磷酸化等生物学术语,且存在着相互关联作用。结论 PAH差异表达特征基因及其功能注释不仅为深入研究疾病发生发展机制提供重要线索,也为有效诊断和治疗疾病提供必要理论基础。
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