5月18日，温州市金融研究院、温州大学金融研究院以及温州大学金融学院同时挂牌成立，温州大学金融研究院和温州市金融研究院实行“两块牌子一套人马”，当地媒体将其誉为温州金融改革“参谋部”，吴敬琏为顾问委员会委员。
　　浙江省副省长、温州市委书记陈德荣在当天的成立仪式上指出，温州金改试验区的获批是温州破解民间金融危机与民营实体经济困局的及时雨，温州市金融研究院要致力于“立足温州，面向全国；研究为本，金改为用”。
　　吴敬琏表示，他不像媒体那么看好温州试验，“它当然有一定意义，但也是吃吃阿司匹林、抹抹万金油。”他解释，地方金融创新是有限的，金融市场不可能画地为牢，如果非要如此，无非是地方行政管制力量膨胀。
　　他建议，大家更应关注郭树清新政。搞好全国性的证券市场，更加有意义，“比如IPO发审制度可不可以不要，就值得好好讨论。”
　　对于深圳前海金融创新，吴敬琏则建议大家看远一点，放到粤港一体化的背景考量。“一个区域性地区的发展，需要强有力的中心城市带动。”在吴敬琏看来，广东的潜在优势是毗邻世界级城市香港，粤港一体化是转变广东整个地区增长模式的关键。
　　“但粤港一体化有很大的障碍，那就是一国两制导致粤港是两个不同的关税区，所以粤港一体化很大程度取决于中央。”吴敬琏说，前海作为一个点，如果成功后进行经验推广，粤港一体化的阻力也会少很多。
　　吴敬琏对于政府掌握资源并主导企业创新的模式表示不赞成。他认为，最近这一年多政府加强了自己在经济发展方式转变中的作用，取得了一些效果。可是效率太低，成本太高。
　　吴敬琏表示，政府要去指定一个产业发展方向，指定一个技术路线，失败概率几乎是百分之百，惟一的办法就是放手让千家万户的企业、让千百万人去探索。其中总有一部分人成功，它的成功就能够带动整个产业、整个国家走向一个成功的道路。
　　（摘自《东方早报》2012年5月21日）