腺病毒4型E3区核苷酸序列测定及其基因结构与功能分析

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本文将Ad4基因组相当于73.3—89.2基因图谱单位(m.U.)则的DNA片段进行了序列测定及基因结构分析,它包括了Ad4E3区全基因及该区两侧的部分序列。序列分析表明,Ad4E3区从TATAAbox起至该区基因结束共4778bp,编码11个大于6kD的开放读码框架(ORF)。对Ad4E3区ORF分析结果表明,Ad4E3区编码的19.3k、15k和10.4k蛋白,分别与Ad2E3区的gp19k、14.7k和10.4k蛋白相对应,具有非常相似的结构。Ad4E3区全基因组DNA与Ad2和Ad3E3区DNA具有较高的核苷酸同源性,分别为50%—55%和55%—60%,这一数值大大超过了Ad4全基因组DNA与其他亚属的同源性(4%—23%)。从以上分析可以看出,尽管腺病毒E3区为非必需区,但在不同型别的腺病毒中都保留着这一区域,而且具有相似的基因结构特征和较高的同源性,说明E3区在腺病毒自然感染中发挥重要作用。
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