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微生态学（Microecology）是一门新兴的边缘学科。1977年联邦德国VOLKER RUSCH首先明确提出这门学科的定义，并在德国建立起第一个微生态学研究所。该所的主要工作是关于活菌制剂（生理性细菌治疗），如大肠埃希菌、双歧杆菌、乳酸菌等，总的来说是研究生态疗法和生态调整。1985年VOLKER RUSCH提出一个新的定义：“微生态学是细胞水平或分子水平的生态学，是研究人类、动物、植物正常微生物群与其宿主相互关系的生命科学分支”，也可以认为是研究微生物结构和功能，及其和宿主相互依赖、相互制约的科学技