【摘 要】
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目的:对筛选的丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白NS3适配子进行测序和结构分析。方法:使用DNAMAN V6软件对适配子序列进行多序列比对分析和最低能量二级结构分析。结果:筛选得到的
【机 构】
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广州血液中心增城区血站,广州血液中心,
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目的:对筛选的丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白NS3适配子进行测序和结构分析。方法:使用DNAMAN V6软件对适配子序列进行多序列比对分析和最低能量二级结构分析。结果:筛选得到的6条适配体随机序列均无同源序列;寡核苷酸适配子的二级结构以茎环和凸环为主。结论:这些适配子特定的空间结构是适配子与HCV NS3蛋白特异性结合的基础。
OBJECTIVE: To sequence and structure the screened NS3 aptamer of hepatitis C virus (HCV) nonstructural protein. METHODS: Multiple sequence alignments and lowest energy secondary structure analysis of aptamer sequences were performed using DNAMAN V6 software. Results: The sequences of the 6 aptamers screened out showed no homologous sequences. The secondary structure of aptamers was mainly stem and loop. Conclusion: The specific spatial structure of these aptamers is the basis for the specific binding of aptamers to HCV NS3 protein.
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