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利用2009年第二次全国R＆D资源清查数据，基于经典的DEA模型，对我国28个制造业行业的R＆D资源配置效率进行分析。结果显示：我国制造业整体的R＆D资源配置效率不高，行业间的R＆D资源配置效率存在较大差距；技术层次低的制造业行业的R8LD资源配置效率普遍低于技术层次较高的制造业行业。最后提出，必须优化资源投入结构、强化经营管理、深化技术创新以及加强人才培养。