【摘 要】
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从分子层面对泛癌进行研究已经得到了很大的进展,但是对宫颈鳞状细胞癌的分子分类研究仍然需要更多的探索.为了找到宫颈鳞状细胞癌潜在的子类,本文提出了一个基于多维组学数据的癌症亚型分类分析流程.通过统计学方法对癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)宫颈鳞状细胞癌的mRNA表达数据、小分子核糖核酸(microRNA,miRNA)表达数据、DNA甲基化数据以及拷贝数变异数据4个维度包含的分子进行筛选,然后对筛选后的分类特征进行整合聚类,进一步筛选能够区分不同子类的关键分类特征,并
【机 构】
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北京工业大学环境与生命学部,北京100124
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从分子层面对泛癌进行研究已经得到了很大的进展,但是对宫颈鳞状细胞癌的分子分类研究仍然需要更多的探索.为了找到宫颈鳞状细胞癌潜在的子类,本文提出了一个基于多维组学数据的癌症亚型分类分析流程.通过统计学方法对癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)宫颈鳞状细胞癌的mRNA表达数据、小分子核糖核酸(microRNA,miRNA)表达数据、DNA甲基化数据以及拷贝数变异数据4个维度包含的分子进行筛选,然后对筛选后的分类特征进行整合聚类,进一步筛选能够区分不同子类的关键分类特征,并使用这些关键分类特征建立宫颈鳞状细胞癌分类模型.本研究为宫颈鳞状细胞癌分子层面子类的识别提供了分析流程,得到了两个临床生存水平具有显著性差异的宫颈鳞状细胞癌子类,并确定了8个宫颈鳞状细胞癌的关键分类特征.本研究中识别的宫颈鳞状细胞癌子类和关键分类特征为宫颈鳞状细胞癌早期分类及分类标志物的鉴定提供了重要参考.
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[目的]在转录水平上分别研究猪粪和树叶为基质的沼气干发酵过程中古菌与细菌的类群演替规律,以及甲烷合成关键酶基因mcrA和16S rRNA基因的丰度变化.[方法]通过Barcoded高通量测序获取沼气发酵原核微生物群落组成,利用定量PCR技术获得mcrA和16S rRNA基因丰度,通过皮尔森(Person)指数的计算,分析发酵系统中各微生物类群间的相关性.[结果]猪粪发酵过程细菌和古菌优势类群分别为严格梭菌属(Clostridium sensu strictol,在不同发酵时期的细菌群落结构占比17％～29
[目的]探究嗜热厌氧杆菌Thermoanaerobacterium aotearoense SCUT27(SCUT27)木糖代谢途径的调控机制,强化葡萄糖和木糖共利用.[方法]通过qPCR、RT-PCR对木糖代谢相关基因xylA、xylB和xylT的共转录及功能进行验证,然后利用基因敲除技术构建rok、lacI和mtlR的敲除菌,以探究其对木糖代谢的调控,最后构建mtlR的过表达菌株,强化葡萄糖和木糖的共利用.[结果]RT-PCR结果显示xylA、xylB和xylT共转录;敲除xylAB后,木糖利用能力下
核仁是细胞内重要的亚核结构,其在恶性病的演变过程中扮演重要角色,是病理学家诊断癌症的重要指标.尽管核仁如此关键,但到目前为止,核仁的荧光探针寥寥无几.本文以水杨酸和1,8-二氨基萘为反应物,通过微波消解法合成了一种新型荧光碳纳米颗粒(FCNs),采用透射电子显微镜、动态光散射仪、傅里叶红外光谱仪、紫外分光光度计、荧光光谱仪等对其物理、化学、光学性质进行了表征、分析.借助激光扫描共聚焦等技术对FCNs的细胞摄取机制及分布进行了探究.实验结果表明,所合成碳纳米颗粒尺寸均匀,最佳激发波长在348 nm,对应的最
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[目的]探究并对比泡沫陶瓷及聚二甲基硅氧烷(PDMS)复合泡沫陶瓷分别作为生物滴滤塔填料时净化甲苯废气的性能.[方法]以该两种材料作为生物滴滤塔填料,比较两台生物滴滤塔的挂膜速度,改变停留时间及营养液中氮源对生物滴滤塔性能的影响.[结果]第6d,入口浓度为1 000 mg/m3、EBRT为38.9s时,PDMS生物塔可以达到80％的去除率,而泡沫陶瓷生物塔仅有40％的去除效率.待稳定运行后,当EBRT为38.9s,进口浓度为600 mg/m3时,两台生物塔尾气中甲苯含量均可达到未检出水平,当EBRT为31
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[目的]研究不同激素组合对甘草愈伤组织形成的影响,诱导甘草胚性愈伤组织的分化与增殖.[方法]以甘草种子为试验材料,通过种子发芽率比较,筛选出发芽率最高的浸种条件.利用植物组织与细胞培养技术,进行愈伤组织诱导与增殖研究,通过调节激素组合对甘草愈伤组织形成的影响进行研究.[结果]浸种40 min条件下,种子发芽率最高达64％;下胚轴为最适合诱导愈伤组织的外植体;MS+6-BA 1.0 mg/L+NAA2.0 mg/L为甘草愈伤组织增殖培养最适培养基;MS+NAA 2.0 mg/L+6-BA 0.5 mg/L有
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