为了更全面了解家蚕卵巢培养细胞(BmN)的转录基因及其涉及的功能,对BmN细胞进行深度RNA测序(RNA-seq).得到的总读段(reads)数为80 968 776条,有效RNA-Seq数据68 672 812条,reads的平均长度为94.85 bp,有效数据达到84.81％,证实测序数据可信.将有效数据比对家蚕mRNA序列,发现BmN细胞中的10 182个基因有不同程度表达.利用qRT-PCR测定随机选择BmN细胞中7个基因的相对表达水平,与RNA-Seq的结果略有差异,但总体趋势表现一致.以家蚕Actin3基因作为参照,计算BmN细胞中表达基因读段倍率变化的log2 (Fold_change),将log2 (Fold_change)＞2的基因定义为高表达基因,共有41个基因在BmN细胞中高表达.选取FPKM值＞15且表达水平最高的100个基因进行GO注释,主要涉及细胞组分、分子功能和生物学进程,富集在细胞组分中的基因比率高于富集在分子功能、生物学进程中的基因比率.KEGG分析显示这100个高表达基因分布在能量代谢,转录,翻译,折叠、组装和降解以及信号转导等22条通路上.比较发现BmN细胞与家蚕卵巢组织之间的高表达基因存在差异.