【摘 要】
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[目的]杂草稻的起源与演化是一个未澄清的热点问题,分子标记技术是最重要的研究手段之一。由于已经应用的分子标记数量有限,与栽培水稻缺乏特异性,因此探索新的分子标记仍然
【机 构】
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南京农业大学杂草研究室/江苏省杂草防治技术工程技术研究中心
【基金项目】
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国家转基因生物新品种培育重大专项(2014ZX08011);教育部高等学校博士点基金优先发展领域课题(20130097130006)
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[目的]杂草稻的起源与演化是一个未澄清的热点问题,分子标记技术是最重要的研究手段之一。由于已经应用的分子标记数量有限,与栽培水稻缺乏特异性,因此探索新的分子标记仍然十分必要。[方法]使用网络基因组数据库中13份栽培水稻和野生稻叶绿体全基因组序列进行比对和分析,针对其中的高频变异区域设计标记引物,进而对60份杂草稻样品的标记区域测序并进行多态性验证。[结果]13份样品叶绿体全基因组中存在1020个单核苷酸多态性（SNP）位点,111个插入/缺失（InDel）位点,表现出丰富的遗传变异;选定其中3个高频变异区
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