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目的通过对肥西县新农合运行情况进行分析，探讨提高新农合运行质量的对策。方法对该县2003～2010年新农合统计信息报表，运用Excel进行统计分析，分析新农合运行情况、参合农民受益情况。结果该县新农合参合率、住院受益率、住院实际补偿比总体上呈上升趋势，但还存在筹资机制不健全、补偿水平偏低、住院患者流向不合理问题，建议建立稳定长效的筹资机制、完善新农合补偿政策、提高基层医疗机构服务能力。结论肥西县新农合制度运行良好，补偿政策在实施过程中逐步得到完善。