【摘 要】
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目的: 对甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MSP)引物设计进行探讨.方法: 使用Methyl Primer Express Software Version 1.0软件、"methprimer"和"MSPprimer"的网
【机 构】
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江苏大学附属人民医院中心实验室,江苏大学附属人民医院血液科,江苏大学基础医学与医学技术学院
【基金项目】
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江苏省自然科学基金;江苏省医学重点人才项目;镇江市社会发展基金
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目的: 对甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MSP)引物设计进行探讨.方法: 使用Methyl Primer Express Software Version 1.0软件、"methprimer"和"MSPprimer"的网上在线软件设计的引物以及参照国外文献的MSP引物对CCAAT/增强子结合蛋白ζ(CEBPζ),CCAAT/增强子结合蛋白δ(CEBPδ)、脆性组氨酸三联体(FHIT)和死亡相关蛋白激酶(DAPK)基因启动子进行MSP扩增,然后对其MSP产物进行测序验证以比较MSP引物设计的可靠性.结果: 对于CEBPζ,CEBPδ,FHIT和DAPK启动子基因所设计的MSP引物经MSP后均获得了所需要的目的条带,但经测序鉴定Methyl Primer Express和methprimer设计的CEBPδ,CEBPζ-1的MSP扩增产物为假阳性产物,而MSPprimer设计的CEBPζ-2的MSP产物为正确序列.结论: MSP引物设计的质量是保证MSP扩增成功的关键因素.
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