【摘 要】
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分别于2011年6月和11月,在武汉东湖和南湖采集沉积物,作为夏季和冬季样品的代表,采用PCR-DGGE(Denaturing gradient gel electrophoresis,变性梯度凝胶电泳)和克隆测序方法研
【机 构】
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农业部长江中下游耕地保育重点实验室; 华中农业大学生态与环境工程研究室;
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(440901264,41371452);国家水体污染控制与治理科技重大专项(2012ZX07307-002,2014ZX07203-010)资助~~
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分别于2011年6月和11月,在武汉东湖和南湖采集沉积物,作为夏季和冬季样品的代表,采用PCR-DGGE(Denaturing gradient gel electrophoresis,变性梯度凝胶电泳)和克隆测序方法研究沉积物中微生物多样性及其季节变化.结果显示,城市湖泊沉积物中微生物多样性十分丰富,冬季两个湖泊沉积物的DGGE条带总数为287条,夏季为317条.冬季和夏季,东湖的平均丰度分别为27.4和31.0,Shannon-Wiener指数分别为2.32和2.78;南湖的平均丰度分别为30.0和32.2,Shannon-Winner指数分别为2.83和2.86.两个湖泊的夏季微生物丰度和多样性指数均高于冬季;同一湖泊各样点之间的相似性更强,说明湖泊内部形成了自身特有的微生物群落结构.克隆测序的结果表明东湖、南湖微生物主要归属于3个细菌类群,其中,变形菌门占有优势地位,其次为拟杆菌门和厚壁菌门,分别占序列总数的77%、17%和6%.变形菌门中,β-变形菌纲和γ-变形菌纲为优势菌种,占序列总数的35%和31%.综上,东湖和南湖沉积物夏季微生物丰度和多样性指数均高于冬季,季节性变化影响了沉积物微生物群落的丰度和结构;本研究结果丰富了对城市富营养化湖泊沉积物微生物多样性的认识.
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