目的了解2018—2020年福建省南平市沙门氏菌血清学分型、分子分型及耐药情况，为沙门氏菌引起的食源性疾病的溯源和临床合理用药提供技术指导。方法依据GB4789.4-2016《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》微生物检验方法和《食源性疾病监测工作手册》对收集到的样本进行检测，采用分离培养及生化实验进行沙门氏菌鉴定，利用玻片凝集法进行血清学试验，利用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术对分离到的菌株进行遗传相关性分析，用微量肉汤稀释法进行耐药性分析。结果55株沙门氏菌菌株分属21种血清型，以肠炎沙门氏菌和鼠伤寒沙门氏菌为主，分别占30.91%和29.09%；食品中分离的沙门氏菌有19种血清型，食源性疾病病例中分离的沙门氏菌有4种血清型；菌株的PFGE形成13种带型，具有多态性，相似度为37.29%～100.00%，总体相似度达到63.77％。同一血清型可出现不同的PFGE带型，部分肠炎、鼠伤寒、唐卜逊沙门氏菌出现成簇现象。沙门氏菌对氨苄西林、萘啶酸、磺胺异恶唑有较高的耐药性，分别达到67.27%、65.45%、54.55%。对三代头孢菌素类药物（头孢他啶、头孢西丁）和庆大霉素以及阿奇霉素等药物敏感。55株沙门氏菌共发现30种不同的耐药谱，氨苄西林-萘啶酸为优势耐药谱（47.27%，26/55），主要血清型包括肠炎沙门氏菌和鼠伤寒沙门氏菌。结论南平市食品中的沙门氏菌血清型和分子分型多种多样，食品和食源性疾病分离出的沙门氏菌对15种药物的耐药率较高且种类多样，半数以上菌株存在多重抗生素耐药问题，要继续加强监测。