【摘 要】
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为更好破译烟草甲全基因组信息,基于Illumina高通量测序平台对烟草甲基因组进行了调查分析。预测了其基因组大小,同时分析了基因组的杂合度、重复序列、GC含量等基因组基本特
【基金项目】
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郑州烟草研究院院长科技发展基金项目“烟草甲RNAi生物防治的靶基因筛选和鉴定”(902018CA0270)
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为更好破译烟草甲全基因组信息,基于Illumina高通量测序平台对烟草甲基因组进行了调查分析。预测了其基因组大小,同时分析了基因组的杂合度、重复序列、GC含量等基因组基本特征,并在此基础上对烟草甲基因组进行了初步组装。研究表明:①烟草甲预估基因组大小为242.25 Mb,杂合率为0.77%,重复序列比率为42.95%,GC含量为44.61%。②基因组组装后,得到418693条scaffolds,拼接序列总长为211.10 Mb,N50为1864 bp。通过基因组调查分析为后续的烟草甲全基因组测序提供了重要
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