【摘 要】
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目的:比较分析帕金森病（Parkinson Disease, PD）和抑郁症（Major depression disease, MDD）在脑组织Brodman9（BA9）区域共同的差异基因（Differential genes, DEGs）、共同通路和关键基因，为PD和MDD共同发病机制研究提供参考。方法:下载GEO数据库中GSE20168、GSE54567、GSE54568和GSE54570芯
【基金项目】
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国家自然科学基金项目，（编号：82160320）； 内蒙古自治区科技计划，（编号：2021ZY0010）； 内蒙古医科大学百万工程项目，（编号：YKD2018KJBW（LH）097;YKD2018KJBW（LH）095）；
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目的:比较分析帕金森病（Parkinson Disease, PD）和抑郁症（Major depression disease, MDD）在脑组织Brodman9（BA9）区域共同的差异基因（Differential genes, DEGs）、共同通路和关键基因，为PD和MDD共同发病机制研究提供参考。方法:下载GEO数据库中GSE20168、GSE54567、GSE54568和GSE54570芯片数据，使用R语言调取limma, clusterProfiler, ggplot2等生信分析包，以P＜0.05并logFC绝对值≥0.3作为标准，分析PD和MDD共表达差异基因，进一步通过GO和KEGG富集分析共同通路，并利用String数据库及cytoscape软件进行蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络和关键基因鉴定。结果:PD和MDD患者BA9区域存在34个共同的DEGs,上调21个，分别为：SLC35E1、ATP8B1、TSR1、ZNF721、RIOK3、FBXW12、ZNF160、POLR1B、CACNA1I、MZT2B、PGF、RP11-403P17.4、RPL23AP32、DBT、PRR11、USP34、LRRFIP1、DSERG1、DIP2A、AEBP1和DNAJB2基因，下调13个，分别为NPTX2、PCSK1、SST、PPP1CB、SEC22B、ENPP4、NME5、CAPZA2、GLRB、ITFG1、GLIPR1、TM6SF1和DUSP6基因；DEGs功能富集分析显示PD与MDD有5个共同的GO＿BP富集条目，分别是：GO:0007611（学习与记忆）、GO:0050890（认知）、GO:0007612（学习）、GO:0051384（对糖皮质激素的反应）、GO:0008306（联想学习）条目，提示PD和MDD均存在认知、学习、记忆及糖皮质激素反应通路功能障碍（P＜0.05）;PPI网络作图及关键基因分析提示NPTX2、PCSK1、DUSP6、SST、PPP1CB基因可能是PD和MDD共同的关键基因，在PD和MDD表达均显著降低（P＜0.05）。结论:前额叶BA9区域认知通路功能障碍及NPTX2等基因表达减少可能是PD和MDD共同的分子病理。
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