【摘 要】
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目的 以脉冲场凝胶电泳(PFGE)为金标准,评价临床实验室应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌(CRECL)进行同源性分析的可行性。方法 收集2018年8月至2019年6月从粤北人民医院住院患者中分离的非重复CRECL菌株10株,编号YG1~YG10。利用Biotyper 3.1软件对CRECL蛋白图谱进行主成分分析(PCA)和核心图谱(MSP)
【基金项目】
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国家重点研发计划项目(2016YFD0500405,2017YFD0501705); 广东省自然科学基金项目(2021A1515012429); 广东省医学科研基金立项课题(B2019205); 广东省韶关市医药卫生科研计划项目(Y19047);
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目的 以脉冲场凝胶电泳(PFGE)为金标准,评价临床实验室应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌(CRECL)进行同源性分析的可行性。方法 收集2018年8月至2019年6月从粤北人民医院住院患者中分离的非重复CRECL菌株10株,编号YG1~YG10。利用Biotyper 3.1软件对CRECL蛋白图谱进行主成分分析(PCA)和核心图谱(MSP)聚类分析,同时进行PFGE同源性分析,并将2种质谱分型方法所得的结果与金标准对比分析。编号为YG10的菌株无法进行PFGE分型被排除。结果 PFGE同源性分析结果与MALDI-TOF MS同源性分析结果有较大差异,PFGE分型结果显示9株CRECL为不同型;MSP聚类分析将9株CRECL分为3型(A型4株,B型4株,C型1株),其中A型的YG3和YG7,以及B型的YG2和YG5水平线距离均为0;PCA聚类分析同样将9株CRECL分为3型(A型2株,B型4株,C型3株)。2种质谱聚类分析都将YG3和YG6分到同一型中,而YG2、YG4及YG8分到另外的同一型中。结论 MALDI-TOF MS有一定的同源性分型能力,但与PFGE同源性分型结果相比较,MALDI-TOF MS的2种同源性分型结果都还有待进一步研究。
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