胃癌相关长链非编码RNA的生物信息学筛选

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目的用生物信息学方法筛选胃癌中差异表达的长链非编码RNA。方法于NCBI公共数据平台GEO下载胃癌基因芯片数据GSE33335,用SAM软件对其进行差异表达分析,对差异表达基因进行重注释并筛选其中的长链非编码RNA,用Gene Cluster和Tree View软件对筛选出的长链非编码RNA的表达情况予以验证。结果针对该芯片数据,筛选出胃癌中差异表达的非编码RNA 15个,其中,表达上调的12个,表达下调的3个,这15个非编码RNA表达值倍数均〉2或〈0.5(q均〈0.05)。结论用生物信息学方法筛选胃癌
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