玉米防御素家族基因进化及表达特征分析

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防御素是一类在动植物中广泛存在的阳离子短肽,参与植物许多生理过程,具有多种防御功能,包括生物和非生物胁迫反应。为明确防御素家族基因Zmdefs在玉米非生物胁迫中的作用,本研究对玉米防御素基因家族成员进行了系统的生物信息学分析和表达特征分析。基于玉米B73参考基因组数据,共鉴定到13个Zmdefs基因,氨基酸大小在73~129之间,均含有2个外显子,分布在1、2、4、5、7和10号染色体上,系统进化分析表明Zmdefs属于第二类防御素。经公共数据库预测,该家族成员主要定位在细胞外,均有信号肽,且存在多个潜在磷酸位点。结合公共数据库的转录组数据分析发现,Zmdefs家族基因对逆境响应不同,Zmdef1,Zmdef8,Zmdef9,Zmdef10和Zmdef11对冷、热、盐胁迫都有不同程度的响应。综上所述,本研究通过比较基因组和转录组数据分析,对鉴定的13个Zmdefs基因家族成员进行系统分析,明确了该家族成员基因的遗传进化及对非生物胁迫的响应,为深入研究Zmdefs基因功能提供了参考依据。
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