【摘 要】
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为了探明秦岭石蝴蝶花瓣数量变异原因,该研究采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术对秦岭石蝴蝶两种花型发育的早期和晚期进行转录组测序,挖掘参与其花发育相关的差异基因,并探讨花器变异的可能机制.结果显示:(1)与NR数据库进行比对,共有52677个Unigene注释到NR库,占Unigene总数的46.25％,与旋蒴苣苔(Dorcoceras hygrometricum)的序列同源性最高(54.29％).(2)GO富集分析结果显示,正常2-3型和变异2-4型差异基因富集最显著的GO条目为:细
【机 构】
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陕西理工大学生物科学与工程学院,陕西汉中 723000;陕西理工大学化学与环境科学学院,陕西汉中 723000;汉中市野生动植物保护管理站,陕西汉中 723000;略阳县苗圃,陕西汉中 724310
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为了探明秦岭石蝴蝶花瓣数量变异原因,该研究采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术对秦岭石蝴蝶两种花型发育的早期和晚期进行转录组测序,挖掘参与其花发育相关的差异基因,并探讨花器变异的可能机制.结果显示:(1)与NR数据库进行比对,共有52677个Unigene注释到NR库,占Unigene总数的46.25％,与旋蒴苣苔(Dorcoceras hygrometricum)的序列同源性最高(54.29％).(2)GO富集分析结果显示,正常2-3型和变异2-4型差异基因富集最显著的GO条目为:细胞组分类的细胞膜、分子功能类的反转运蛋白活性和酶抑制剂活性、生物过程类的跨膜转运和催化活性的负调控等;KEGG富集分析结果显示,正常2-3型和变异2-4型差异基因富集最显著的KEGG通路为:植物激素信号转导、脂肪酸延长、戊糖和葡萄糖醛酸酯的相互转化、苯丙烷生物合成、硫代谢、类黄酮生物合成、玉米素的生物合成等途径.(3)对表达差异基因进行筛选并进一步对4个比较组进行交叉比对分析,确定了6个可能与秦岭石蝴蝶花器官发育相关的基因,分别为PqMIF2、PqMYB340、PqMYB305、PqGA-TA12、PqCCD4和PqZBED;qRT-PCR验证发现,其表达趋势和转录组测序分析结果一致.该研究结果为秦岭石蝴蝶的花器官发育和系统进化及其濒危机制方面研究提供了重要的信息.
其他文献
类根瘤菌26膜内在蛋白(nodulin 26-like intrinsic proteins,NIPs)是水通道蛋白的亚类,在植物营养获取和胁迫应答过程中发挥着重要作用.该研究利用多种生物信息学软件,对葡萄NIP家族基因进行分析,并采用RT-PCR方法克隆得到4个NIP家族基因,利用qRT-PCR方法分析非生物胁迫下NIP基因的表达特征.结果显示:(1)在葡萄基因组中,共鉴定到8个NIP基因,分布于葡萄4条染色体上,主要定位在质膜中;结构上含有6个跨膜结构域和两个典型的保守结构域NPA;氨基酸序列中存在很
针对安塞油田部分水源井无水停运问题,引入了“地下水资源富集程度”概念,并利用数值模型分析了安塞油田区域地下水资源富集程度和水源井停运原因,提出了水源井挖潜对象筛选原则.结果表明:研究区西北部主要河流河谷区的地下水资源富集程度较好,西部黄土丘陵地带以及东部河谷区地下水资源富集程度较差,东部黄土丘陵地带地下水资源富集程度差.水源井无水停运主要因为水源井布设在地下水资源富集程度较差区域.在挖潜对象筛选时应避开现状开采井过于集中、局部开采强度过大的区域(超采区),应分布在地下水富集区,并注意与现有正常运行的油田水
该研究以菊花彩瓣突变体CQ17-mu为材料,利用RT-PCR克隆获得了类黄酮-3\'-羟化酶基因(F3\'H),该基因开放阅读框全长1527 bp,编码508个氨基酸,与已知的菊花CmF3\'H相似性达到99％,故将其命名为CmF3\'Ha.氨基酸序列分析表明,CmF3\'Ha编码的蛋白具有保守的F3\'H结构域,属于P450超家族.多重序列比对和系统发育分析表明,CmF3\'Ha与其他菊花品种的F3\'H亲缘关系最近.实时定量PCR分析显示,CQ17-mu花瓣中CmF3
通过简单的水热法,在I-辅助的情况下,首次在不使用任何有机封端剂的情况下,获得了均匀的类红细胞状Bi2WO6.为了分析影响Bi2WO6形貌的前提条件,我们尝试改变I-浓度、水热时间和温度,并提出可能的生长机理.I-吸附在Bi2WO6纳米片的表面,以防止纳米片过度积聚并引导它们形成类红细胞的结构.独特的层状结构一方面增加了比表面积并提供了更多的反应位点,另一方面还提高了表面酸度并提高了吸附能力.“,”Uniform erythrocyte-like Bi2WO6 was obtained by means
该研究利用海岛棉\'新海21\'和陆地棉ND203以及模式植物拟南芥,通过转基因及荧光定量检测等方法探究海岛棉GbHCT13基因(GenBank登录号MW048849)在纤维发育中的功能.结果显示:(1)成功构建重组载体pCAMBIA3301-GbHCT13,经农杆菌介导法转化、除草剂抗性基因筛选、荧光定量检测方法鉴定获得转GbHCT13基因拟南芥T3代植株4株;qRT-PCR检测表明,转基因植株中GbHCT13基因表达量较野生型极显著增加.(2)转基因拟南芥过表达GbHCT13基因使植株同一时期
该研究运用常规石蜡切片技术,对大花君子兰(Clivia miniata Regel)大、小孢子发生及雌、雄配子体发育进程进行解剖学观察分析,以探讨君子兰生殖生物学解剖特征,为君子兰种子发育和育种提供理论依据.结果表明:(1)大花君子兰花药4室,具分泌型绒毡层.(2)小孢子母细胞减数分裂的胞质分裂为连续型,小孢子四分体为左右对称型,成熟花粉为二细胞型.(3)倒生胚珠,双珠被,厚珠心和雌配子体发育为蓼型.(4)记录了雌雄配子体发育的对应关系,发现雄配子体发育趋于同步,雌配子体发育不同步.(5)开花散粉时,雌配
该研究以斑地锦茎叶为材料,利用同源克隆结合RACE和Tail-PCR法,克隆了1个黄烷酮-3-羟化酶(F3H)基因,命名为EmF3H(GenBank登录号为MW767838),其ORF区为1092 bp,编码364个氨基酸.生物信息学分析显示,EmF3H蛋白相对分子质量为40.93 kD,等电点为5.47,属于2-酮戊二酸铁依赖的双加氧酶超家族,其氨基酸序列与油桐的序列相似性为85.5％,在系统进化上为相对独立的一个分支.采用Tail-PCR法获得1604 bp的EmF3H启动子序列,分析发现其内含TAA
为探明元宝枫花性别、交配系统及花芽分化过程,通过石蜡切片和连续解剖观察,对元宝枫花开放及花芽分化过程进行了研究.结果表明:(1)元宝枫花性别可分为雌能花和雄能花两种,雌能花花药不开裂,只表现雌性功能,而雄能花分Ⅰ型和Ⅱ型两种,花药均可产生成熟花粉并开裂散粉,只表现雄性功能.(2)元宝枫是较为少见的二重雌雄异型异熟树种,且交配系统有雄先型和雌先型两种;雄先型小花开放顺序为:雄能花→雌能花→雄能花,雌先型小花开放顺序为雌能花→雄能花→雄能花.(3)元宝枫花芽的形态分化期开始于7月上旬,花序和小花分化期为8月上
为解析发菜吸水和干燥条件下的基因差异表达规律以及发菜适应“干-湿”水分节律调控机制,该研究以充分吸水发菜藻体为对照组,干燥状态下的发菜藻体为处理组,采用高通量Illumina HiSeq PE150测序平台结合生物信息学分析方法对发菜吸水和干燥条件下的差异表达基因进行分析.结果显示:(1)发菜吸水和干燥条件下共鉴定到差异表达基因3383个,其中显著上调和显著下调表达的基因数分别为1767个和1616个.(2)GO功能富集分析发现,在吸水和干燥条件下发菜差异表达基因主要富集在蛋白质合成与代谢等相关途径中;K
该研究以黄瓜“津春2号”cDNA为模板,采用RT-PCR方法克隆得到黄瓜叶绿素降解关键酶(pheophor-bide a oxygenase,PAO)基因(CsPAO),对其进行亚细胞定位观察,并采用实时荧光定量PCR技术和生物信息学技术,分析了CsPAO基因的表达模式及其编码蛋白的特性.结果表明:(1)CsPAO编码545个氨基酸,理论等电点为6.09,蛋白相对分子质量为61.02 kD.蛋白预测发现,黄瓜CsPAO属于不稳定蛋白,具有2个蛋白结合位点,且存在跨膜现象.(2)荧光定量PCR结果表明,Cs