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以2010—2018年中国沪深A股490家制造业上市公司为研究样本,从行为额外性视角,研究政府补助对企业合作创新的驱动机制,并进一步分析公司治理与要素市场因素在其中的调节作用,研究发现:第一,政府补助可从资金、信号、项目三方面作用驱动企业合作创新的形成;第二,公司治理水平越高,政府补助驱动机制越能得到有效放大,从而进一步驱动企业间合作创新;第三,所在要素市场发育程度越高,市场资源配置越加合理,企业更加倾向于采取R＆D活动来获得超额收益,政府补助也越能发挥更好的资源引导驱动作用。本文的研究发现为全面了解政府补助作用机制、调控政府补助实施效果及促进制造企业加快转型升级提供一定的理论支持与参考。