目的探讨5例鹦鹉热衣原体肺炎的诊断及临床特点。方法 2019年2月-2020年4月由复旦大学附属中山医院感染病科收治5例诊断为鹦鹉热衣原体肺炎的患者,对其临床资料进行回顾性分析,总结该疾病的临床特征及诊治要点。结果 5例患者以高热、咳嗽为主要表现起病,均有鸟类或家禽接触史,白细胞基本正常,中性粒细胞轻度升高,高敏感C-反应蛋白和血沉明显升高,胸部CT表现为某一肺叶炎症渗出和实变,严重者出现呼吸衰竭,应用多种抗菌药物治疗效果不佳。呼吸道样本(痰、肺泡灌洗液、肺组织)通过宏基因二代测序技术检测出鹦鹉热衣原体核酸序列,结合临床表现及接触史以明确诊断。其中肺泡灌洗液mNGS检出的病原体序列数较痰标本多,且没有口腔定植菌的干扰,还可以识别是否合并其他细菌、病毒等感染。及时调整以四环素类药物为基础的治疗方案后病情好转,缩短了鹦鹉热衣原体肺炎的诊断时间和病程,减少不必要抗菌药物的使用。结论宏基因二代测序技术用于诊断鹦鹉热衣原体肺炎具有重要意义,特别适用于肺部感染病原体不明的人群,及时使用合适的抗菌药物治疗效果良好。