自新冠肺炎疫情暴发后，以极快的传播速度在全球蔓延，威胁着人们的生命安全和身体健康，使得应急物资需求极为迫切，从而引发了应急物资短缺、采购分配不合理、运输时效性差以及供需信息不对称等一系列问题。本文基于新冠肺炎疫情这一重大公共卫生事件，搭建了信息共享的应急物资采购、运输及分配供应链超网络体系；基于公平性、时效性以及经济性三个原则构建了多目标均衡模型，将其转换为等价的变分不等式，给出了模型的求解算法，并通过算例验证了模型的有效性和可行性。此外，本文探讨了疫情严重程度(疫区城市内医院疫情严重程度和路途中疫情严重程度)、汇率、物流承运商防护态度以及疫区城市内医院需求满足率对采购、运输以及分配方案的影响。研究表明：应急物资采购、运输以及分配的时效性和经济性之间存在背反现象。随着所用货币相对于中国货币汇率的上升，应优先选择从国内制造商采购应急物资，保障应急物资供应链网络的时效性和经济性；随着新冠肺炎疫情不断发展，受灾人数不断增加，疫区城市内医院的相对公平满意度降低。