基于网络药理学探讨黄芪治疗慢性肾脏病的分子机制

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目的:基于网络药理学探讨黄芪治疗慢性肾脏病(chronic kidney disease, CKD)的分子机制。方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)检索黄芪的有效成分及其相关靶点;在GeneCards、DrugBank Online数据库中检索CKD相关靶点,与黄芪活性成分相关靶点进行映射,交集靶点即为黄芪治疗CKD的潜在靶点;将黄芪治疗CKD的潜在靶点导入String数据库绘制蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,并采用CytoScape 3.9.1软件进行拓扑分析,筛选出黄芪治疗CKD的核心靶点;利用Metascape数据库对黄芪治疗CKD的核心靶点进行基因本体(gene ontology, GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)信号通路富集分析;利用CytoScape 3.9.1软件构建“黄芪-活性成分-潜在靶点-信号通路-疾病”网络图。结果:基于TCMSP检索到黄芪有效成分20个及相关靶点204个;检索GeneCards、DrugBank Online数据库得出CKD相关靶点1 266个,将黄芪活性成分相关靶点与CKD对应靶点导入Venny 2.1.0,得到黄芪治疗CKD的潜在靶点104个;PPI网络拓扑分析筛选出53个黄芪治疗CKD的核心靶点;KEGG信号通路富集分析获得32条信号通路,GO功能富集分析得到生物过程、细胞组分及分子功能各104个。结论:黄芪可通过多成分、多靶点、多通路治疗慢性肾脏病。
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