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为了从本质上揭示H1N1病毒分子的变异、流感流行等关系，提出一种构建H1N1型流感病毒进化树的新方法。在1902—2013年全球22 455条H1N1型流感病毒HA蛋白序列和16 444条NA蛋白序列数据的基础上，利用其特征向量构建基于内积的蛋白序列相似度；采用基于相似度的完全聚类图的方法进行数据系统粗粒化的相似信息提取；最后，利用基于模糊邻近关系的结构聚类方法构建H1N1型禽流感病毒HA、NA蛋白序列的进化树及算法研究。试验结果表明：H1N1病毒的变异不仅与爆发时间密切相关，还与所分布地域及地域间的距离