HBV 基因组的重叠结构和免疫选择压力是调节其进化的关键因素

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乙肝病毒( HBV)逆转录酶( RT)和HBV S抗原( HBVsAg )基因间的重叠如何调节HBV 基因变化的程度仍是一个令人不解的问题,本文对此进行了研究。由于RT和HBsAg之间的重叠,RT基因的非典型模式提高了核苷酸的保守率(变异性≤1%)(重叠区的核苷酸保守率为69.9%,而非重叠区的则为41.2%;P<0.001),其结果是在重叠区内的同义替代率较低[中间数dS=3.1(1.5~7.4)对20.1(10.6~30.0);P=3.249×10-22]。最保守的RT区位于RT功能性关键的掌区与指区的YMDD模体内和N-端部分,这些区域也与高度保守的分泌HBsAg的关键区相一致。相反,编码HBsAg抗原性环的基因组区其保守的程度显著低下(40.6%),而这在发生HIV衍生性免疫抑制情况下差异不大。总结起来,重叠的阅读框架和免疫系统看来可决定RT和HBsAg遗传变异性的模式。 RT和HBsAg的高度保守区可作为新的治疗标靶值得进一步关注。
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