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根据期刊影响因子的含义,分析了其目前在研究生科研绩效评价应用中存在的若干问题:具有不同来源期刊结构的数据库和不同学科领域的期刊影响因子的混合使用是对影响因子的误用.提出了不同数据库的合理匹配以及对同一数据库中不同学科领域的期刊影响因子给予恰当处理的应用方案,并就发挥影响因子等文献计量学指标的评价效力等问题作了进一步的理性思考.