【摘 要】
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本研究通过克隆香樟植物的1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(DXS)基因,进行生物信息学分析,为香樟DXS基因的功能及其表达调控提供基础.根据香樟转录组数据中注释为DXS的核苷酸拼接
【机 构】
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国际竹藤中心,国家林业局竹藤科学与技术重点实验室,北京,100102
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本研究通过克隆香樟植物的1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(DXS)基因,进行生物信息学分析,为香樟DXS基因的功能及其表达调控提供基础.根据香樟转录组数据中注释为DXS的核苷酸拼接序列,设计特异性引物,进行香樟DXS基因的克隆,应用荧光定量PCR方法分析DXS基因在香樟根、茎和叶中的表达量.克隆获得香樟DXS基因,其cDNA序列长度为2 333 bp,开放读码阅读框(ORE)为2 187 bp,编码728个氨基酸,含有转酮醇酶等3个保守结构域.香樟DXS蛋白定位于叶绿体,是一个不含信号肽、无跨膜结构域的亲水性稳定蛋白,且蛋白二级结构主要为α-螺旋和无规则卷曲.通过氨基酸序列同源性分析发现,香樟DXS氨基酸序列与黄兰和鱼腥草的DXS氨基酸序列相似性较高,均为85％.分子进化树结果表明,香樟DXS蛋白与黄兰DXS蛋白亲缘关系较近.组织特异性表达分析结果显示,DXS在香樟叶与茎中的表达量高于根.成功克隆获得香樟DXS基因,研究结果为进一步探讨香樟DXS基因在萜类物质生物合成途径中的作用提供理论依据.
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