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互联互通是目前全球各国健康医疗大数据使用面临的最大壁垒。互联互通涉及业务、安全、伦理、语义和技术5个维度，本文在比较政府主导、企业主导和研究机构主导3种常见互联互通模式的基础上，结合中国健康医疗大数据的发展现状，提出高校牵头、企业助力和政府支持的工作模式。同时，归纳出目前我国健康医疗大数据互联互通面临的3大挑战：行业标准与规范、数据安全与伦理、激励机制与考核。唯有采用切实可行的模式，攻克相关关键技术，真正将数据打通共享，才能最大限度的整合多来源数据，挖掘多应用场景，培育多业态模式，全面提升人口健康科学决策和服务管理水平。