【摘 要】
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目的：分析夏枯草转录组中简单重复序列（SSR）信息,为开发夏枯草新的分子标记奠定基础。方法：使用Micro SAtelite（MISA）软件对转录组序列进行SSR位点搜索并利用Primer3软件设计引物。
【机 构】
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河南中医药大学药学院,呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心
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目的：分析夏枯草转录组中简单重复序列（SSR）信息,为开发夏枯草新的分子标记奠定基础。方法：使用Micro SAtelite（MISA）软件对转录组序列进行SSR位点搜索并利用Primer3软件设计引物。结果：发现4248条Unigenes序列中含有5450个SSR位点,发生频率为27.50%,平均每5933 bp含1个SSR位点;二核苷酸、三核苷酸和单核苷酸重复是其优势重复类型,分别占总SSR数量的44.59%、28.44%、24.75%;在夏枯草转录组中共发现160种重复基元,其中以AG/CT比例最高
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