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饱和脂肪酸及其同位素组成是重建古环境和古气候的重要代用指标，目前存在多种提取及纯化流程。在全球变化研究中，基于不同原理的纯化流程得到的脂肪酸含量及其同位素组成是否一致，直接影响着该指标应用于不同区域重建结果的对比。本文用两种常见的脂肪酸纯化流程提取脂肪酸标准、现生植物和泥炭样品类脂物，通过对比发现：对脂肪酸标准两种流程都可以得到纯净的单体脂肪酸，而且回收率均较高（85％以上），都是较为可靠的脂肪酸纯化流程；然而对于天然样品，虽然高碳数脂肪酸（碳数〉C24）的回收率相近，流程l却能够获得相对较多的低碳数饱和