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为评价野生稻与亚洲栽培稻的遗传多样性及其变异关系，56对SSR引物被用于研究广泛地理分布的55份普通野生稻（其中32份O．rufipogon和23份O．nivara）和25份亚洲栽培稻（14份indica和11份japonica）样本。298个多态性位点被检出，占总扩增等位点的98．68％。野生稻多态性位点的百分比（平均达91％）及Nei’s遗传多样性值（h）明显高于亚洲栽培稻，表明普通野生稻比亚洲栽培稻具更丰富的遗传多样性。UPGMA聚类分析显示野生稻的两个类群（O．rufipogon和O．nivara