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建立由２Ｄ ＮＯＥＳＹ谱峰强度计算蛋白构象的方法，先用完整弛豫跑阵分析方法程序计算Ｈ－Ｈ原子间距约束，然后用距离几何算法程序计算出三维空间结构。用再有约束的分子动力学算法程序结合能量优化程序精化结构，并模拟了该结构的ＮＯＥＳＹ谱峰强度与实验ＮＯＥＳＹ谱峰强度与实验ＮＯＥＳＹ谱峰强度对比，经多次迭代计算与精化得到合理稳定的蛋白质构象，用ＢＰＴＩ前３０肽晶体结构进行模拟测试，表明本方法是成功可行的。