了解我国HIV-1毒株CRF01_AE亚型在省内和省际的传播规律和风险因素，为实施精准干预提供参考依据。
方法收集我国19个省份1996－2014年已有的2 094条CRF01_AE pol区基因序列，利用PhyML 3.0软件构建系统进化树，确定传播簇，利用Cytoscape 3.6.0软件构建传播网络，结合背景信息分析传播风险。
结果发现82个传播簇，包含255条序列（12.18%，255/2 094），省内传播簇数量和包含序列数（61个，173条）明显多于跨省传播簇（21个，82条）。传播簇中男男性传播人群的成簇比例随时间上升趋势明显，由1996－2008年的2.41%（2/83）上升为2013－2014年的23.61%（72/305）（χ2=27.800，df=1，P=0.000）。跨省传播簇的男男性传播人群比例明显高于省内传播簇，由1996－2008年的0.67%（2/297）上升为2013－2014年的6.36%（30/472），具有随时间的上升趋势（χ2=20.276，df=1，P=0.000）。跨省传播簇中男男性传播的比例（86.59%，71/82）明显高于省内传播簇（56.65%，98/173），差异有统计学意义（χ2=22.792，P=0.000）。含2种及以上传播途径的跨省传播簇的比例（33.33%，7/21）明显高于省内传播簇（13.11%，8/61），差异有统计学意义（χ2=4.273，P=0.039）。传播网络分析发现，跨省传播簇内高传播风险人群比例（51.22%，42/82）明显高于省内传播簇（26.59%，46/173），差异有统计学意义（χ2=14.932，P=0.000）。跨省传播簇以男男性传播人群为主。
结论我国HIV-1毒株CRF01_AE亚型存在复杂的传播网络，跨省传播簇快速增长，其中高风险传播者对HIV-1亚型的大范围传播起到重要作用，应深入进行传播网络研究以指导精准干预。