基于转录组测序花烟草响应盐胁迫活性氧清除相关基因的挖掘

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为了鉴定参与花烟草盐胁迫响应的活性氧清除相关基因,用200 mmol/L NaCl处理花烟草幼苗,并在处理后12 h采集其幼苗样本,提取总RNA,采用高通量测序技术,进行转录组测序。基于差异表达基因GO及KEGG分析的基础上,对参与其中的活性氧清除基因进行挖掘,利用qRT-PCR的方法验证转录组测序结果。结果表明,盐处理后,花烟草基因表达量变化在2倍以上的基因有7239个(P<0.01),其中,上调表达基因4037个,下调表达基因3162个,将其功能归类于生物过程、细胞组分及分子功能三大类159个G
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