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随机抽取我院儿科诊室2010年12月～2011年12月收治的手足口病并脑干脑炎患儿26例,观察临床表现并分析其MRI结果。结果在26例患儿中,有阳性5例,阴性21例。病灶多分布于延脑和脑桥交界处,且随访结果显示此处病灶会逐渐减小。临床上患儿表现为眼球异常运动和肢体震颤等。手足口病并脑干脑炎的MRI表现与临床表现相关联,它可以提高有效影像辅助诊断和治疗,适合应用于临床上。