【摘 要】
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单核苷酸多态性(SNPs)是一个物种中DNA序列中某个位点上的碱基变化,研究单体型对于诊断疾病和药物研制有着重要作用。基于信息工程的单体型重建就是对由SNP片段组成的基因片
【基金项目】
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长春市2009年中小企业发展专项资金项目(09YJ36);吉林省中小企业发展专项资金项目(SC201101001)
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单核苷酸多态性(SNPs)是一个物种中DNA序列中某个位点上的碱基变化,研究单体型对于诊断疾病和药物研制有着重要作用。基于信息工程的单体型重建就是对由SNP片段组成的基因片段进行组装,从而构造出原来的一对单体型。本文在k最近邻和粒子群算法的基础上,提出一种解决单体型重建问题的一种聚类算法。最后,本文分别采用模拟数据和真实数据来检验本文所提出的算法,实验结果证明所提出算法的可行性与高效性。
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