目的分析并评价2009-2011年和2012-2015年两时间段甘肃省发热呼吸道症候群(FRS)病原的检测情况及监测能力,为提高其监测质量提供依据。方法利用2009-2015年甘肃省13家哨点医院的监测数据,描述性研究两时间段各病原的检测检出及阴性病例症状分布情况。结果两时间段甘肃省FRS所有细菌和病毒的总检测率分别由0. 5%、8. 7%上升至24. 9%、76. 2%,且差异均有统计学意义(χ~2=1 072. 054,P <0. 05和χ~2=3 382. 581,P <0. 05)。两时间段所有细菌的总阳性率分别为0. 3%和62. 4%,所有病毒的总阳性率由38. 4%下降至27. 9%,总阳性率在两时间段的差异均有统计学意义(χ~2=8. 622,P <0. 05和χ~2=16. 317,P <0. 05);对两时间段的阴性病例进行症状分析,结果显示阴性病例均以中重度症状为主。结论 2009-2011年和2012-2015年甘肃省FRS的监测能力有所提升,但仍存在病原检测率与阳性率较低等问题,应加大所有病原尤其是细菌的检测力度,加强对阴性病例的重复检测,以提高病原的检出水平,进一步提高甘肃省FRS的监测质量和监测能力。