【摘 要】
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为深入解析核桃GRAS基因家族在低温胁迫中的生物学功能,本研究根据生物信息学模型搜索核桃基因组中GRAS基因,采用ExPASy、MEME、GSDS、MEGA6.0、String和Plantcare等软件分析
【机 构】
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河北农业大学园艺学院,河北省山区农业技术创新中心,河北农业大学生命科学学院,中国林业科学研究院林业研究所/国家林业和草原局林木培育重点实验室
【基金项目】
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国家重点研发计划项目(2019YFD1001603),国家自然基金(32072524,31672116),河北省自然科学基金(C2019204270)。
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为深入解析核桃GRAS基因家族在低温胁迫中的生物学功能,本研究根据生物信息学模型搜索核桃基因组中GRAS基因,采用ExPASy、MEME、GSDS、MEGA6.0、String和Plantcare等软件分析该家族成员理化性质、基因结构、保守基序、进化关系、启动子区域结合位点及蛋白功能互作等,分析GRAS基因家族在低温胁迫下表达模式。聚类分析发现,据拟南芥分类将核桃GRAS基因家族分为9个亚族,分别为HAM、DELLA、SCR、SCL、LISCL、LS、SHR、PAT1和NEWCLASS;每个成员蛋白磷酸化
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