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以丝瓜基因组DNA为模板,采用正交实验设计L16（45）,在4个水平上对影响丝瓜SRAP反应的Taq酶、Mg2＋、模板、dNTP及引物等5个因素进行了优化,建立了丝瓜SRAP-PCR的最佳反应体系。利用18份丝瓜自交系材料来验证此反应体系,均可扩增出清晰、可辨的条带,可见该反应体系较稳定,适用于丝瓜SRAP标记的扩增。