【摘 要】
：
[目的]基于生物信息学方法筛选肾透明细胞癌表达芯片中共同过表达的miRNAs,并对其下游靶基因进行GOPathway、分子功能等预测,结合正常本底表达及患者生存分析,最终发现可作为
【机 构】
：
江苏省丹阳市人民医院检验科,江苏丹阳212300
论文部分内容阅读
[目的]基于生物信息学方法筛选肾透明细胞癌表达芯片中共同过表达的miRNAs,并对其下游靶基因进行GOPathway、分子功能等预测,结合正常本底表达及患者生存分析,最终发现可作为肾透明细胞癌生物标记物的新miR-NA.[方法]利用dbDEMC 2.0人类癌症相关miRNA数据库、mirPath v.3、Human miRNA tissue atlas、PROGmiRV2等多种生物信息学手段进行肾透明细胞癌中miRNAs的全方位分析.[结果]dbDEMC 2.0数据分析表明相对于正常组织,肾透明细胞癌组织中,分别存在上调miRNA 33个(GSE11016)、48个(GSE12105)和48个(GSE47582).Venny分析得到13个共同上调miRNAs簇,该microRNAs簇仅在肾透明细胞癌、乳腺癌等部分癌种中高表达.mirPath v.3 GO分析进一步显示,下游靶基因可能与脂肪酸代谢、细胞周期、TGF-β信号通路、Hippo信号通路等密切相关.Human miR-NA tissue atlas揭示miR-21-5p、miR-342-3p、miR15a-5p、miR-25-3p和miR-34a-5p等5个miRNAs在正常肾脏组织中显著高表达.生存分析表明只有miR-21-5p和miR-342-3p高表达与预后差显著.[结论]结合多种生物信息学手段发现,与正常组织比较,肾透明细胞癌组织中存在共同过表达miRNA簇且与脂肪酸代谢、细胞周期等信号通路密切相关;其中miR-342-3p由于高表达、预后差且未见报道而极有可能成为肾透明细胞癌新的生物标记物.
其他文献
[目的]将购自ATCC的ST贴壁细胞通过自主驯化,使其能在甘肃健顺生物科技有限公司(简称健顺生物)自产的无血清培养基CD ST 258中悬浮生长且能稳定传代,在反应器中能高密度生长.
介绍了清江公司（湖北清江水电开发有限责任公司）安全管理信息化建设的主导思想,从安全管理模块的结构入手,阐述实现手段,达到公司系统内安全信息横向、纵向畅通的目的,促进各级
本文针对清江公司（湖北清江水电开发有限责任公司）梯调中心电力生产旧报表系统存在的问题,介绍了该报表系统的改造方案,并分析了改造后报表系统的成果.新报表系统界面友好,操作
怎样知道母乳够不够 黄医生：我的孩子才满月，平时爱哭闹，我不知道是不是奶水不够的缘故。怎样才能看出奶水够不够? (上海)刘 佩 答：婴儿喂饱后，一般能自动放开乳头，并能安睡3小时左右，体重增长情况正常，表示母乳充足。若婴儿吸奶超过20分钟后仍不肯放开乳头，有时猛吸一阵然后吐出乳头，哭闹不安，或喂奶后1～2小时就哭闹不安，睡睡醒醒，都是没有吃饱的表现。特别是体重增加缓慢，是判断母乳不足的依
本文通过《毛泽东选集》的语料分析,从语义、句法功能和语用三个方面对“必须”的用法进行了考察。总结出该词在语义、句法和语用上的不同特点。
Through the corpus analys
冼夫人的生卒年月,由于史籍记述不详,至今未能确定。我们不揣冒昧,就所掌握的有关资料,对此作初步研究。一查《北史》卷九十一和《隋书》卷八十,与冼夫人生卒年代有关的记述
《克里农的安格因夫人》是意大利画家萨特金于1892年创作的油画。画面上安格因夫人神态安详,目光温和,含情脉脉,宁静的如同夕阳下的湖波。画家放弃了古典的完美写实技艺,以潇
[目的]探讨银杏叶提取物(GBE)调控缺氧致心肌细胞凋亡的潜在分子机制.[方法]使用银杏叶提取物处理缺氧心肌细胞H9c2,检测其凋亡水平.通过高通量测序检测银杏叶提取物处理后缺
1995年元月15日至16日,全省劳动安全卫生工作会议在汉召开。会议总结了1994年全省劳动安全卫生工作,部署了1995年《湖北省实施办法》的宣传贯彻及压力管道的安全管理工作,确