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目的：比较腔镜下Soave根治术与开腹改良Soave术治疗长段型先天性巨结肠（HD）患儿的疗效，观察两种术式对应激反应和控便功能的影响。方法：选取我院2017年4月～2020年9月期间收治的长段型HD患儿88例，根据手术方式的不同分为开腹组和微创组，例数分别为43例和45例。对比两组围术期指标、应激反应指标、控便功能和并发症发生情况。结果：微创组的术中失血量少于开腹组，手术时间、胃肠功能恢复时间、禁食时间、住院时间短于开腹组（P＜0.05），两组肠管切除长度组间对比无统计学差异（P＞0.05）。两组患儿术后1 d心率（HR）、平均动脉压（MAP）较术前升高，血氧饱和度（SpO2）较术前下降，但微创组HR、MAP低于开腹组，SpO2高于开腹组（P＜0.05）。两组患儿术后1年大便性状、排便次数、污粪、需要治疗（灌肠、药物、尿布）评分及Heikkinen总分均较术前升高，且微创组高于开腹组（P＜0.05）。微创组的近期并发症总发生率和远期并发症总发生率均低于开腹组（P＜0.05）。结论：与开腹改良Soave术相比，采用腔镜下Soave根治术治疗长段型HD患儿可缩短手术时间、禁食时间、住院时间、胃肠功能恢复时间，减少手术创伤，减轻机体应激反应，改善患儿控便功能，同时还可降低并发症发生率，效果较好。