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中国检验检疫科学研究院卫生检疫研究所是专门从事出入境人员传染病检疫、疾病监测、卫生监督和卫生处理技术的研究机构，拥有先进的仪器设备，现有技术人员15人，其中高级技术职称6人，博士3人，硕士7人。学科涉及细菌学、病毒学、免疫学、分子生物学、毒理学、药理学、医学媒介生物及生态学、消杀灭及卫生安全评价等。下设外来传染病研究室、口岸卫生安全研究室、口岸医学媒介生物研究室、卫生药械研究室。另外，本所与中国人民解放军军事医学科学院合作，成立了卫生检疫技术联合研究开发中心。