党的十八大把生态文明建设提升到“五位一体”战略布局的高度,自然保护区作为生态文明建设的重要手段和途径,其作用日趋凸显。我国自然保护区一直存在行政管理体制不顺的问题,具体表现为纵向责权不清、横向职责交叉,严重影响了自然保护区的健康发展,社会各界对此反应强烈,急需改革完善。2014年,云南省对完善自然保护区行政管理体制作了积极探索,研究印发《云南省自然保护区管理机构管理办法(试行)》,启动了行政管理体制改革。通过改革,取得了一定成效,但问题并未完全得到解决。笔者借助新公共管理、新公共服务等相关理论进行了分析,从自然保护区存在的价值,经济社会对自然保护区发展的要求,以及现行自然保护区行政管理体制的不足入手,详细分析了开展改革的原因,并借鉴了中国政法大学薛刚凌教授的行政管理体制改革模型,从职能定位、权力配置、运行规则、法律保障等4个方面设定了自然保护区行政管理体制改革的目标。然后,笔者采取文献研究法、调查研究法,结合云南省2014年自然保护区行政管理体制改革的具体情况进行分析,并运用对比研究法,找出云南省自然保护区行政管理体制改革与我们设定的自然保护区改革政策目标的差距,分析造成这一差距的原因,针对差距提出了完善的对策建议,对策建议将对拟订进一步深化改革的措施提供重要参考。本文体现了理论研究对实践工作的回应和指导,同时也为深化云南省自然保护区行政管理体制改革提供了决策依据。