HMM在生物序列分析中的应用

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【摘要】

：

阐明HMM的基本理论与概念,进而总结介绍HMM应用的基本问题与算法;重点介绍并分析了可用于表示序列家族的几种HMM结构特点,并说明了利用已知家族Profile HMM构造多序列比对的

【作者】

：

陈雄峰

【机构】

：

闽江学院计算机科学系

【出处】

：

闽江学院学报

【发表日期】

：

2007年5期

【关键词】

：

HMM 序列家族基因发现 HMMsequence family gene finding

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阐明HMM的基本理论与概念,进而总结介绍HMM应用的基本问题与算法;重点介绍并分析了可用于表示序列家族的几种HMM结构特点,并说明了利用已知家族Profile HMM构造多序列比对的方法;阐述了常用于基因发现的GHMM和目前常用于发现基因结构的HMM结构特点;最后介绍一种结合多种基因发现工具的HMM主要思想.

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