背景与目的以表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)为靶点治疗非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是现在治疗肺癌的前沿手段,因此检测EGFR是否突变成为治疗肺癌的关键一步。本研究旨在探讨直接测序法和ARMS法检测NSCLC患者的EGFR基因突变情况及检出率。方法收集自2012年4月-2013年6月本中心接受进行EGFR基因突变检测的NSCLC患者,分别用直接测序法和ARMS法对这些患者的肿瘤组织标本进行检测,检测其中EGFR基因第18-21外显子的突变情况,并比较两者方法的优劣。结果在该451例两种方法均检测的患者中,两种方法均检测到突变且突变结果一致者127例,结果不一致者5例,均无突变者186例,直接测序法检测到突变而ARMS法未检测到突变者50例,反之83例。50例中有33例为ARMS法29种突变之外的突变。直接测序法检测的突变率为40.4%,ARMS法检测的突变率为47.7%,ARMS法的突变检出率明显高于直接测序法(P<0.001)。在204例石蜡组织中,ARMS法的突变检出率59.80%明显高于直接测序法41.67%(P<0.001);而在240例新鲜组织中,两种方法无统计学差异(P=0.083)。结论直接测序法和ARMS法检测EGFR基因突变基本一致,ARMS法更为灵敏,且操作方便快捷,但是价格昂贵。对于肿瘤组织含量较少的样本中,ARMS法更为敏感,明显优于直接测序法。直接测序法可以检测到ARMS试剂盒内不包含的少见突变。结合两种方法检测结果更为可靠全面。