【摘 要】
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病毒与宿主细胞在遗传信息上具有相似的字模式（k-tuple）,病毒的DNA序列与其可感染的宿主细胞的DNA序列通过字模式的统计打分值往往比与随机宿主细胞的打分值高,也就是病毒和其
【机 构】
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华南理工大学物理与光电学院,中国工商银行广州东城支行,中山大学中山医学院计算机中心
【基金项目】
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国家自然科学基金青年基金资助项目（11205061,11205062）
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病毒与宿主细胞在遗传信息上具有相似的字模式（k-tuple）,病毒的DNA序列与其可感染的宿主细胞的DNA序列通过字模式的统计打分值往往比与随机宿主细胞的打分值高,也就是病毒和其可感染的宿主细胞的DNA序列有一定的相似性.基于此原理,文中利用序列非比对统计方法 D_2~S和D_2~＊对病毒的DNA序列和宿主细胞的DNA序列基于字模式进行比对打分,将打分值与获得的阈值进行比较,判断该病毒是否能感染宿主细胞.实验结果表明,当k=5（k为字模式的的大小）、马尔可夫阶次为1时,D_2~S和D_2~＊统计量均能较好
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