小鼠胚胎期与成熟期肝脏表达谱芯片数据挖掘及生物信息学分析

来源 :中国医药导报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:pengguanxin
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目的深度分析小鼠胚胎期与成熟期肝脏差异表达基因。方法从美国国家生物技术信息中心(NCBI)的GEO数据库下载编号为GSE65063的基因表达谱数据,提取其中胚胎期14 d及生后56 d芯片,采用在线分析工具GEO2R完成差异表达基因(DEGs)筛选。使用DAVID对DEGs进行基因本体论及京都基因与基因组百科全书生物学通路富集分析,采用STRING分析DEGs所编码蛋白质之间的相互作用,结合CytoScape软件进行可视化;运用CytoScape软件中加载的MCODE进行功能模块构建,利用CytoHubb
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